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药物鉴别方法通常有化学法、光谱法、色谱法、生物学法等几大类
化学法有制备衍生物测定熔点、呈色反应、沉淀反应、气体生成反应、焰色反应等方法。
光谱法有紫外光谱法、红外光谱法等。药物结构不同，会得到不同的紫外光谱和红外光谱，借此进行鉴别。
色谱法有薄层色谱法、纸色谱法、高效液相色谱法、气相色谱法。药物分子由于结构不同，吸附或分配等性质不同，所以在一定的色谱条件下可产生差速迁移，根据药物分子的保留值等特征色谱行为可对药物进行鉴别。
对于某些有特殊生物效应的药物，可根据药物的特殊生理活性将药物通过各种途径给予微生物、动物或动物的离体器官，观察药理作用以鉴别药物，多用于抗生素及生化药物的鉴别。
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